O IUPE, com Instituto de Pesquisas, precisava de um colégio para que todas as metodologias produzidas pudessem ser constantemente aplicadas, avaliadas e aperfeiçoadas.

Assim foi criado o Colégio IUPE, mantido pelo Instituto, iniciando com as etapas que vão do 6º ano do Ensino Fundamental II até o 3º ano do Ensino Médio.